한국과 일본 사이의 정기 항로가 완비되어 있다.
일본항공(JAL:JL), 전일본공수(ANA:NH), 대한항공(KAL:KE), 아시아나(AAR:OZ), 제주항공(JJA:7C), 노스웨스트(NWA:NW), 유나이티드항공(UAL:UA) 등의 항공회사에서 서울, 부산, 제주로부터 일본의 주요 도시에 정기적으로 한일노선을 운항하고 있다.
일본항공(JAL), 전일공(ANA)을 비롯한 여러 항공사가 전국에 걸쳐 광범위하게 노선을 운항하고 있다. 일정이 바쁜 여행자 혹은 신칸센이 운행되지 않는 지역으로 갈 때에는 국내선이 편리하다. 예약은 주요 여행사나 JAL(일본 내 전화 0120-25-5971), ANA(일본 내 전화 0120-029-222)로 하면 된다.
국제 선박로
부산에서 일본의 후쿠오카(福岡)시, 시모노세키(下関)시, 오사카(大阪), 대마도(対馬)로 정기편 항로가 연결되어 있으며, 강원도 동해시에서는 돗토리현(鳥取県)의 사카이미나토(境港)로 정기 취항하고 있다.